原來，研究人員認為這一舉動直接威脅到工作人員的健康。張樹義研究員介紹，蝙蝠有可能攜帶病毒，如狂犬病毒，如果不小心被蝙蝠咬傷，后果不堪設想。另外，張樹義研究員認為“蝙蝠是有益的動物類群，絕對不能因為保護古建筑而傷害它們。”

　　就像大禹治水一樣，對付蝙蝠要用疏導的辦法。

　　王毅男博士說，可以為蝙蝠在附近建一個新家——蝙蝠屋。蝙蝠屋應該能防雨，因為蝙蝠不喜歡潮濕，室內比較黑，因為蝙蝠是夜行動物，喜歡黑暗。另外，張樹義研究員還建議工作人員把寺里的環境變化一下，讓它住得越來越不舒服。比如蝙蝠不喜歡光，那就適當加強獨樂寺的光亮；再比如它習慣腥臭的氣味，就讓獨樂寺的氣味變得清爽一點。